『ゾイドサーガDS：レジェンド・オブ・アルカディア』は、「ゾイドサーガ」シリーズの完結編です。
本作には、初代『ゾイドサーガ』、『ゾイドサーガII』（海外版タイトル：Zoids: Legacy）、そして『ゾイドサーガIII：フューザーズ』のシーンが含まれており、グラフィックやサウンドも強化されています。さらに、TVアニメ『ゾイドジェネシス』からのゾイドやストーリー要素も新たに追加されています。
ゲームシステムは伝統的なJRPGスタイルで、プレイヤーは歴代ゾイド作品のキャラクターや機体を操作します。敵ゾイドはフィールド上を徘徊しており、接触するとターン制バトルが始まります。本作は、@Traceeytrace によって2022年に英語パッチが制作されました。
基本的なゲームプレイは従来の『ゾイドサーガ』と同様ですが、タカラトミーはDSのデュアルスクリーンを活用して「レーダーシステム」を導入。レジーナは主人公に「アーム・レトコム」という左腕に装着する不思議なデバイスを渡してくれます。これはマップ、アイテム探知、罠の検出、ゾイド発掘機能を備えたレーダー腕時計で、現在はレベル1ですが、中盤以降でどんどんアップグレード可能です。
パーティはロンが待つ廃墟へ向かい、パーティが準備完了を伝えると、ロンは自分のバンブリアン・ゾイドで仲間に加わります。
メトゥ廃墟では、探索中にザイリンに尾行されます。ここでザイリンはバイオ・メガラプターを操縦しますが、すべてのバイオゾイドと同じく、彼のゾイドはパーティのゾイドの防御を無視して攻撃してきて……痛っ！ でも、事前に少しレベル上げしていたので、パーティは一ターンで撃破できました。
戦闘後、ザイリンは逃げる前にルウジを炎のブレスで攻撃。パーティは追えません。「逃げられたのは俺のせいだ。もし……もっと強ければ……」とルウジは願います。この瞬間、ムラサメとアトレーのサウロナイトの間で何かが起こり、二人も驚きます（ゲーム内では後でこの仕組みがさりげなく説明されます）。レイ・ミーは何が起きたのか不思議に思いますが、アトレーは「まるで……」と言うだけで、それ以上は話さず、レイ・ミーは不満げに「はっきり言えよ」と迫ります。ラ・カンはパーティに先へ進むよう促します。
廃墟の奥でパーティはセイジュウロウと出会いますが、外で地震が発生。全員が先に退避し、ルージとコトナは彼に近づきます。ルージは強くなるためにセイジュウロウに訓練をお願いしたいのですが、セイジュウロウは断ります。その直後、地面が再び揺れ（外では戦いが激しくなっている模様）、ルージとコトナはパーティを助けるため廃墟を出ます。
外ではオーピスがアトレーとパーティを奇襲し、二連ボス戦が発生（連続で二回戦うので「二連」です）。ルージは「村を救うまでは止まらない」と宣言し、オーピスを苛立たせます。オーピスがルージに攻撃しようとしたところをセイジュウロウが阻止し、狂気の科学者を止めます。セイジュウロウはパーティに加わり、ルージは彼を師匠として受け入れます。これによりパーティ編成を再調整し、三度目のボス戦（同じ敵との三連戦！？ちょっと疲れる……）。
オーピスとのマラソンボス戦開始！戦え、アトレー！戦え、ルージ！戦え、戦え、戦え！
